Desde o ano de 2001 o Programa de Conservação e Manejo dos Pinípedes do Litoral Sul - NEMA em parceria com a antiga Superintendência do Porto do Rio Grande, vêm desenvolvendo atividades de monitoramento dos refúgios de Pinípedes no Litoral do Rio Grande do Sul, bem como, o monitoramento da ocorrência de mamíferos marinhos na região adjacente ao Porto do Rio Grande.  

O trabalho integrado as atividades de educação ambiental, os monitoramento das praias adjacentes ao Porto do Rio Grande e o acompanhamento da dinâmica de ocupação dos Pinípedes do Refúgios da Vida Silvestre do Molhe Leste, mostra-se como uma metodologia adequada para a avaliação do status de conservação dos Pinípedes na região.  Por outro lado, a qualificação e ordenamento das atividades de turismo com vagoneteiros, tem valorizado os processos de gestão socioambiental do Molhe Oeste. Assim, como a manutenção da Sala do Pescador, no Porto Velho, tem sido fundamental o contato com os pescadores e funcionários auxiliando o trabalho de educação e gestão dos resíduos sólidos e oleosos na área do Porto Velho.

Dentre os desafios de conservação dos pinípedes, destaca-se: os efeitos da interação antrópica, principalmente com a atividade pesqueira. Existe uma sobreposição entre o alimento dos pinípedes e o produto de interesse das pescarias da região sul do Rio Grande do Sul. Para enfrentar esses desafios, o Projeto Pinípedes do Sul executará ações indicadas como prioritárias no Plano de Ação Nacional para a Conservação dos Grandes Cetáceos e Pinípedes (ICMBio, 2011): monitorar a presença e a sazonalidade de leões e lobos marinhos em refúgios de descanso, como o Refúgio da Vida Silvestre - REVIS do Molhe Leste, para avaliar a presença e a mortalidade sazonal dos pinípedes e demais mamíferos que frequentam a região sul do Brasil.